但无论征伐高丽的军事收获如何，是胜是败，杨广大肆滥用民力，搞得全国不堪重负民不聊生确是不争的事实。
为了做出征的准备，先是在大业七年三月命令幽州总管元弘嗣到东莱海口造船三百艘，官吏们督促工程，工匠、役丁们昼夜站立在水中，不敢停下稍微休息一下，自腰以下都生了蛆，病累而死去的人有十之三、四；四月征发天下兵卒，无论远近，都在涿郡集中。又征发江淮以南的水手一万人，弩手三万人，岭南排镩手三万人，于是从全国各地奔赴涿郡的兵卒川流不息；五月，命令河南、淮南、江南等地制造兵车五万辆送往高阳，作为后勤运输车辆，征发河南、河北民夫以供应军需。七月，征发江、淮以南民夫以及船只运输黎阳和洛口各粮仓的米到涿郡。水上运输船只首尾相连绵延千余里。陆上运载兵器铠甲以及攻城器械的人常达几十万人。拥挤于道，昼夜不停，病累而死的人互相枕着，路上到处散发臭气。堪称全国总动员，不宁累鸡犬。
更严重的是，由于这种战争准备，必然涉及到物资的征收，官吏贪狠暴虐，借机渔肉百姓，百姓穷困，财力枯竭。加上徭役繁重，错过农时，造成田地荒芜，谷价上涨。当年又有水灾，黄河也被堵塞，倒流几十里。这个时候，安分守己则无法忍受饥寒，死期也将迫近；抢劫掠夺则还可能活命，大规模的农民起义开始爆发。
大业九年二征高丽时，由于已经经历过一次战火，更多的人有了厌战情绪，尤其是王薄作《无向辽东浪死歌》，劝大家不要去边关送死，不仅是民夫逃亡，连军中的士卒也纷纷投奔，很快就聚起了十余万人的队伍。这只是一个代表，与此相对应的是在大业七年之前，几乎没有什么起义军，大家对杨广的穷奢极欲都能默默忍受，征伐高丽，成为了压倒杨广的最后一根稻草。当然，这根稻草颇有些沉重。
三征高丽时，杨广所召集的部队很多都未能到位。固然是由于路上盗匪横行，官军不易通过，但也有很多官军直接脱了军装（甚至穿着）当盗匪。杨广的政权已经摇摇欲坠，之所以草草结束这次征伐，这也是主要原因。