与此同时，黑眼圈终于领悟了释放黑暗次元多玛姆的魔法，成了多玛姆的信徒。
然后他们攻击了雾都圣所，并把奇异博士轰到了哥谭市圣所。
奇异博士也在那遇到了自己的挚爱斗篷君。
经过一番室内版盗梦空间式的打斗之后，奇异博士抓住了黑眼圈。
黑眼圈开启话痨模式，介绍了自己的动机和目的，为的是让人类进入暗黑次元，以便得到永生。
奇异博士也从中知道，古一大师也是吸取了黑暗次元的力量，所以能活那么久。
聊完之后，古一大师依然从始至终没有出现，但黑眼圈的徒儿赶来，刺伤了奇异博士，奇异博士把自己传送回医院，让女助理给他治疗。
被刺到心脏的奇异博士，通过电击和简单缝几针，完全康复。
他重新回到圣所，制造了一个镜像世界，把黑眼圈他们拉进里面，这样他们的打斗可以对真实世界不造成任何破坏。
古一大师这时终于加入战斗，一场城市天空版的《盗梦空间》打斗开启。
古一大师运用太多法力，露出暗黑次元的身份，但古一还是没能击败黑眼圈，自己坠入现实世界摔成重伤。
奇异博士想要救古一的时候，古一出现在窗外。
她和奇异博士的那番对话，堪称漫威宇宙最诗意也最东方禅意的对话。
古一感叹完了之后，撒手人寰，留下个烂摊子给奇异博士处理。
古一大师的死，让奇异博士从挽救自己双手，蜕变成挽救全人类。
奇异博士他们去到香江，发现香江圣所已经摧毁，多玛姆正在吞噬地球。
奇异博士利用时间宝石和咒语，锁定了一个循环，进入暗黑次元，多玛姆一次次杀掉奇异博士，而奇异博士则一次次循环复活。
最终，多玛姆被奇异博士的死缠烂打弄到崩溃，决定放弃地球，并带走黑眼圈他们。
无疑，《奇异博士》这部电影给观众送上了十分焕彩的奇异视觉，同时也很好的塑造了曾经自以为是的奇异博士，如何变成默默无闻守卫地球的超级英雄。
抛开特效和视觉，奇异博士的性质其实和钢铁侠、蚁人一样，属于不想做英雄，最后却成了英雄的半路决定论故事，当然这也是传统的超级英雄成长套路之一。
影片不管从剧情，对白，道具等方面，都围绕着时间这个议题展开，包括片中正反两派的核心矛盾，同样是时间。
时间把人们化解为生老病死，但暗黑次元却可以无视时间的存在，也就是所谓的永生。
时间的议题再展开，和古一大师为代表的东方神学紧密相连，这也是影片有意思的地方，漫威第一次把东方的一些哲学思考，以及信仰的精神放入到影片中，并让其和奇异博士这个代表的西方思维模式进行对撞和冲突。
古一大师临死的时候，和奇异博士的那番对话，可以说是影片的高光时刻。
当时古一大师就说到，我避免多次可怕未来，最终还是来到了这一刻。
之后古一大师预言奇异博士的未来，她从未看过穿奇异博士的未来，只看到其可能性，她相信奇异博士能成就更大的贡献，但最终的他无法成就伟业，并说奇异博士并不重要，还说如果奇异博士利用魔法让自己的手复原，世界将变得更加危险。
之后奇异博士说，他还没准备好，古一大师说，谁都不会准备好，时机由不得我们选。
这些话在后来回头看，意味深长，首先奇异博士如果成就小我，恢复自己的双手，必然他不想成为超级英雄，更不会去到《复仇者联盟3》。
在《复联3》中，奇异博士看到14000605种可能，只有一种能打败灭霸，而且那人不是他，这也印证了古一大师那句“成就大业并不是你”。