他声称是虔诚的罗马天主教徒，以及“沉思”的目的是为了维护基督教信仰。
但是在他自己的真正表现上，笛卡尔被指控宣扬秘密的自然神论和无神论信仰。
他的挚友布莱兹·帕斯卡说：“我不能原谅笛卡尔；他在其全部的哲学之中都想能撇开上帝。
然而他又不能不要上帝来轻轻碰一下，以便使世界运动起来，除此之外，他就再也用不着上帝了。”
乔勇，张梁这些大明帝国的使者们认为，按照大明学术的分界来看笛卡尔先生，他正处在一生中最重要的时刻——顿悟！
顿悟过去之后，便是他成为圣人的高光时刻。
就像大明的王阳明先生在军营练气，忽然长啸一声，声震十里……
笛卡尔先生以为抵达罗马的时候，就是他上火刑柱之时，没想到，他才住进了罗马的宗教裁判所，那个下令捉他来罗马受刑的教宗就突然死了。
然后，在某一个阳光明媚的清晨，他离开了牢房，见到了等候他多时的外孙，与外孙女。
离开的时候，笛卡尔先生没有刻意的去感谢教宗亚历山大七世。
他简单的认为，一个接受过俗世最高等教育的亚历山大七世绝对是一个眼界开阔的人士，不用感谢他，相反，教宗应该感谢他——笛卡尔还活着。
他自认为，自己的头颅已经不属于他自己，应该属于全法国，甚至属于全人类……
虽然监狱没有伤害他，他虚弱的身体还是不能让他立刻离开罗马回到巴黎，因此，他选择住在阳光明媚的罗马，在这里修整一段时间，顺便让人去找教宗讨回属于小笛卡尔以及艾米丽的那笔财富。
两年时间，小笛卡尔已经成长为一个英俊的少年了，小艾米丽也长高了很多，只是，笛卡尔先生最得意的地方在于小笛卡尔似乎遗传了他的相貌，在刚刚进入少年期之后，小笛卡尔的脸上就长了一些雀斑，这与他少年时期很像。
只是他们两人头发的颜色不一样，笛卡尔先生的头发是黑色的，而小笛卡尔与艾米丽的头发是金色的。
女仆跟男仆都留在了法国巴黎，所以，能照顾笛卡尔先生的人只有小笛卡尔与艾米丽。
经过一个漫长的黑夜之后，笛卡尔先生从沉睡中醒来，他睁开眼睛之后，立刻感谢了上帝让他又多活了一天。
不过，在艾米丽伺候着洗漱之后，笛卡尔先生就看到了桌子上丰盛的早餐。
尤其是两只烤的金黄的斑鸠，更是让他欢喜。
不过在老先生将他认为的斑鸠肉送进嘴里的时候，小笛卡尔道：“这是鸽子肉。”
笛卡尔先生立刻大笑起来，上气不接下气的指着小笛卡尔道：“广场上的那些鸽子？”
小笛卡尔没有笑，冷冷的道：“教皇不需要那些鸽子。”
“这不是教皇的错，有错的是上一任教皇。”
小笛卡尔用叉子挑起一块鸽子肉道：“我吃的也是上一任教皇的鸽子。”
笛卡尔先生大笑道：“这应该能说得通。”
吃过早饭之后，两位笛卡尔先生开始去散步了，这是小笛卡尔先生要求的，他认为这样做能让外祖父活的时间再长一些。
笛卡尔先生看到了小笛卡尔手中的书，皱眉道：“你对东方很感兴趣吗？”