但众神实在太寂寞了，于是，十二尊神化作人形进入凡界地，跟各族结合通婚，慢慢有了后代。尊神后代的逐渐融合，上古神脉的血缘越来越稀薄。于是便开始不再细分是何种神族，都生来直接入了神籍。
因为正统之神代代相传，然能精于修炼的后代，少之甚少，于是上古尊神流传下来的神力，便一代代式微，也逐渐融入凡地界。然总有淘汰未完全的败者，时时隐没出现，每每一出现，后神无法压制，便是三界大乱之时。
又因十二尊神后代无需修行，一出生便有仙体神籍。于是天上的神仙便越来越多，为争夺仙山与河域争斗不休。后来是有紫薇，东华，太微，太一等十二帝君共平乱，重建九宸天秩序，推举太微为天帝陛下，总领九宸天之事。
同期的十二帝君逐渐神隐消亡，独独留下了紫薇帝君与太微玉帝。紫薇帝君本已经不理世事，然尚无后辈出色者，逢有大难，紫薇帝君便不得不撑着一把老骨头，重御苍穹剑出手。紫薇帝君甚为苦恼。
我们的女主角阿薇，白薇仙子的一家子的身世说来实在是复杂，实在一言难尽。
这还得从魔尊重楼的爷爷辈说起，而魔尊重楼的爷爷辈就得从上古十二尊神的血脉传承说起。
上古时期，三界十二尊神化为人形之后，重订了十二神族，有善医者称医族，有善桑田者称农族，善仆算之术号称巫族。这些神族后代生来性情温和，幻化人形之后容貌俊美。
却有两族生出来的后代例外，巫族和医族结合生出来一个后代。不是普通神族，似有返祖之象，其外貌奇丑，却像上古十二尊神那样法力亦无边。最为人忌惮的是，无法自控，脾气暴躁，为祸四方。
因此另外的十大尊神禁止巫神与医神两族再通婚，却禁不住。巫神和医神的长子烛尤，一日之内杀了数千神族，三界被魂魄所困，暗不见天日。十大众尊神终于忍无可忍，合力众仙把巫医两神族合族剿。
却不想巫神与医神幼子重楼尚未修成人形，因巫神与医神又用元神护着，众尊神用尽了千百种方法，也毁之不掉。上古十尊神最后将重楼逐出神籍，合用十元神为契，才把这个重楼彻底封印。
然而万万年之后，众尊神皆消亡，重楼却逐渐苏醒，占方寸山为界，吸纳周边小妖鬼怪入魔族，自封为魔尊重楼。
魔尊重楼践踏地狱，游戏人间，上南天门，挑战紫薇帝君。
寂寞多年的紫薇帝君与之棋逢对手，引为知己。有帝君约束，魔尊重楼行事也收敛了些。
一日魔尊重楼与紫薇帝君大战，不慎右肩为苍穹剑所伤。苍穹剑所伤之处，伤口不仅不能愈合，还不断延伸扩大。路过瑶池，不慎跌入万芳园，长英仙子并未嫌弃魔尊重楼貌丑，更未因其是魔族而疏远，反而赠药相救。
魔尊重楼为长英仙子美貌所倾，便隔三差五上南天门挑战，屡屡与紫薇帝君相战受伤，借此便去找长英仙子。
久而久之，这貌丑心善的魔尊重楼居然俘获了长英仙子的芳心。长英仙子因此跟随魔尊重楼离了万芳园，去了方寸山。万芳园从此无人看守，导致百草丛生，百花凋零。
西王母得知真相大怒，一纸上诉到天帝陛下，天帝早想讨伐魔尊重楼，因众神皆畏惧，紫薇帝君又不肯支持，又找不到合适的理由而罢休。
如今魔尊重楼掠夺天界仙子，霸占为妻，正是惹怒众仙，因此天帝命紫薇帝君率百家仙门讨伐魔尊重楼，围剿方寸山，引发了神魔大战。