在佑介正式担任宇智波一族族长之后不久，火之国大名便在火之国都城召见三代火影、火影顾问以及佑介，共同商讨关于提名佑介成为新任火影顾问的事宜。
在商议开始之前，大名单独会见了佑介。
虽然佑介用「别天神」将意志强加给了大名，但是却并不会改变大名的人格或是对常理的认知。
因此大名除了对佑介绝对信任外，其他的处事方式并没有发生任何变化。这也是「别天神」这个幻术的神奇之处。
这次会见中，佑介直言不讳的批判了三代所领导的木叶管理层。在他们的管理之下，木叶短短几年便从强盛走向了衰弱。
几年之前，木叶还有白牙、三忍、黄色闪光、团藏以及宇智波富岳等等高手坐镇，可谓是一时鼎盛，没有哪个忍村敢捋木叶的虎须。
然而现在白牙自杀、三忍离村、黄色闪光昏迷不醒；团藏的根组织和宇智波一族也是自相残杀，导致了团藏以及根组织覆灭，宇智波一族也是损失惨重。
这一切，无不说明三代火影以及他领导下的管理团队的无能。
在佑介有理有据的分析以及「别天神」的影响下，大名完全认同了佑介的观点，对三代火影以及现任的两名火影顾问也十分的不满。
借着这个机会，佑介提出了重组木叶管理层的方案，得到了大名的支持。
在之后与三代以及两名火影顾问的会议当中，大名亲自提出佑介规划的木叶管理层重组的方案，在现有的基础上又添加了首席顾问和名誉顾问两个席位，来帮助火影进行决策。
虽说是‘帮助’，但是任何人都能看出这其实是在制衡火影，大大削弱了火影的话语权。
三代以及两名顾问虽然提出了异议，但是在大名的坚持之下，最后也只得无奈妥协。
当佑介以及三代火影等人回到木叶之后，三代不得已将大名的提出的三项任命正式公布了出来。
这三项任命让木叶所有人都无法置信，也让所有势力都察觉到到木叶的权利分配将会迎来新一轮的洗牌。
第一个项任命是指定现任宇智波一族族长宇智波佑介为首席火影顾问，首席火影顾问的地位要高于火影顾问。
任命的原因是嘉奖佑介破除了团藏以及根组织破坏木叶稳定的行为，并曝光了团藏以及根组织大量的罪行，同时也是为了纪念整个宇智波一族自参与建立木叶以来为火之国所做的贡献。
第二项任命则是新增加一位名誉顾问。
大名对目前木叶高层的近年来的无所作为十分不满，决定安排了一位名誉顾问代表大名监督木叶高层。当木叶高层在决策上出现重大分歧时，可以通过上报大名来做最终决定。
这位名誉顾问自然就是佑介为自己寻找的帮手，增加自己在高层决策时的话语权。
第三项任命则是一个全新的职位。木叶将新建‘木叶研究院’，专门进行忍术和忍具的开发，由佑介担任该第一任院长并全权负责研究院的修建与运转，同时原本隶属于根组织的研究人员全部划归到木叶研究院中。
自此，宇智波一族正式回归到木叶的政治核心，而宇智波佑介这个名字也传遍了整个忍界。
现在的佑介已经身兼四个身份，火影首席顾问、木叶研究院院长、木叶警务部部长以及宇智波一族族长。
手握重权的佑介立刻开始整顿宇智波一族，将三名家族长老的权利全部收回，交由奏一郎和鼬来管理。