崇祯怒道：“好心？这是什么好心，又是划地盘，又是给种子的，这是让流寇寄居在大明身上！到了某个时刻，就给朕闹出一个篓子！”
温体仁回道：“那陛下是要拒绝吗？如此，流寇牵扯我们大部分精力，北方的女真鞑子怕是会趁机攻打我们了。”
崇祯闭眼叹气道：“此事先拖着，让山西各路官兵继续剿匪。”
此事搁置后，刘元昭见明廷没有回音，便让苏泰丰返回。
十一月，高迎祥、李自成、张献忠、罗汝才等突破明军防线，于毛家寨渡黄河，陷渑地。十二月下宜阳、卢氏、内乡至南阳(今皆属河南)遂入湖广。破夔州(今四川奉节)逼四川。明军所在告急。
这时候崇祯急了，他连忙派人去找刘元昭，希望他派人去与流寇谈判，让他们接受明廷招抚。
刘元昭将书信搁置，对此事不理不睬。
因此，崇祯再度怒斥刘元昭背信弃义，意欲切断互市。
首辅温体仁赶紧劝慰道：“陛下，如今我们已经与女真鞑子敌对，如果再惹怒刘元昭，那真是不堪重负了！陛下三思！”
崇祯怒视温体仁，说道：“就把粮食等紧俏物资拦下，如今朝廷正是缺粮食，为何这些商人还有粮食出口国外？
都是奸商，让锦衣卫给朕查，抓起来，抄家！全部充公！”
刘元昭对于崇祯的举动很是不满，于是派人向辽东地界散布明廷内部的不少重要消息。
十二月，甘肃西和有约六级地震，震中烈度为七至八。
刘元昭治下归德都督府的洮州卫和临洮府都有震动。
此事一发生，言官皆言此事是崇祯德行不够，上天惩罚，崇祯不得已下了罪己诏，平息各路言论。
很快，崇祯六年过去，崇祯七年到来，广鹿岛(位辽东半岛东南海中)副将尚可喜降于金。
尚可喜字元吉，号震阳，祖籍山西洪洞，后至河北衡水，明万历四年（1576年）其祖父尚继官举家迁往辽东海州（今辽宁海城）。
尚可喜戎马一生，身经百战，转战数万里，为清王朝的建立和巩固立下了汗马功劳，在清代历史上写下了浓重的一笔。
康熙年间，晋封为平南亲王。康熙十五年（1676年）十月二十九日，平南王尚可喜在广州薨逝，享年七十三岁。康熙皇帝赐谥曰敬。
孔有德在海上被黄龙杀得抱头鼠窜，损兵折将，认为是平生奇耻大辱，发誓必报此仇。待得安顿好部属，就撺掇皇太极攻打旅顺。
皇太极一直也以明军占据旅顺威胁沈阳南路耿耿于怀，孔有德此议正中其下怀。崇祯六年六月，皇太极命贝勒岳托、德格类、多铎，汉军石廷柱等率马步兵一万出击旅顺，孔有德、耿仲明率所部随征。
自从尚可喜皮岛救驾后，黄龙甚为感激，委以重任，信用甚专。海上堵截孔耿，尚可喜勇打头阵，斩获甚重。
孔耿逃脱后，黄龙命尚可喜驻防鹿岛，离旅顺约有六七百里，三五天内两下里接应不上。七月初四，后金军从陆路由北而南围攻旅顺。黄龙得报，知道来者不善，急忙派人出海调尚可喜回援，同时奋力抵抗。
坚守三日之后，七月初六，后金军攻上旅顺城，黄龙仍然指挥部队殊死战斗，被围数重，苦战不得出。
眼看突围无望，黄龙将朝廷赐给他的征虏前将军印信交给部将谭应华，用他耳鼻尽失后特有的音质含混不清地叮嘱，让谭应华奋力突围，把印信带到登州上交朝廷，如冲不出去，就将印信丢入大海，说完之后，向南跪拜，自刎而亡。
守城明军数千人大部分阵亡，后金军也死伤数千。尚可喜的家眷都在旅顺，城破之后他的几位夫人不甘受辱都投海而死。
黄龙生性贪鄙，当了东江总兵之后，私欲恶意膨胀，大肆吞剥军饷，比毛文龙犹有过之，其贪欲之强之奇足可载入史册，由此给了暗中窥视总兵之位的沈世魁利用兵变发难之机。
演武场上，一顿折辱，黄龙耳鼻尽失，威严扫地。后虽经尚可喜将其救出，但黄龙羞惭无地，五官不全，已无颜号令三军。最后离开皮岛这个伤心之地，率偏师来到旅顺驻扎。